实验室实行依托单位领导和实验室学术委员会指导下的主任负责制，设实验室主任1 名、副主任2名，全面负责实验室工作。实验室秉承“以人为本”的管理理念，在工作中充分体现管理的科学性、民主性与规范性。
根据自身需要，实验室制定了相应的规章制度，其中包括：《实验室管理细则》、《实验室研究组长聘任办法》、《实验室研究组长考核办法》、《实验室室务会工作条例》、《实验室行政、业务与技术安全条例》、《实验室课题档案管理暂行办法》、《实验室仪器设备管理暂行办法》、《实验室公共实验仪器室管理办法》、《实验室经费管理办法》、《实验室专项经费使用与管理办法》、《开放课题申请指南》、《开放课题经费管理办法》等。
